Le microbiote, qu'est-ce que c'est ?

Tu penses que ce sont tes muscles ou ton cerveau qui dirigent ton corps ? Et si je te disais que le vrai boss… c’est une communauté de microbes logée dans ton ventre ? Bienvenue dans l’univers fascinant du microbiome : un monde de bactéries, virus, champignons, archées qui jouent un rôle déterminant dans ta vie quotidienne.
Ce système complexe, souvent réduit à un simple mot (et quelques pubs de yaourts fermentés), influence en réalité ta digestion, ton immunité, ton système nerveux, ton métabolisme, ton foie, ta vulve... bref, tout ton organisme.
Et quand il se dérègle (ce qu’on appelle la dysbiose), les signaux sont clairs : troubles digestifs, inflammation, fatigue, acné, maladies chroniques, voire troubles de l’humeur. Mais ce n’est pas une fatalité.
Chez Circles, on te propose de mieux comprendre ce monde vivant pour faire de ton microbiote intestinal une extension naturelle de ton bien-être. C’est le moment d’en reprendre la gestion 💪
Définition du microbiote
Tu vis en colocation avec des milliards de microorganismes. Oui oui, toi, en tant qu’être humain, tu n’es pas seule dans ton corps. Sur ta peau, dans ta bouche, ton intestin, ton vagin, même jusque dans ton oreille interne, évolue une communauté microbienne aussi discrète qu’essentielle à ta santé.
Cette population invisible mais bien vivante, c’est ce qu’on appelle le microbiote.
Il est composé de :
- Bactéries (les plus nombreuses),
- Champignons,
- Virus,
- Protozoaires,
- Et même d’archées.
Bon à savoir : Le terme microbiome désigne l’ensemble de ces microorganismes + leur matériel génétique. C’est un concept fondamental en microbiologie, très utilisé dans les publications scientifiques (comme dans INRAE, Proc Natl Acad Sci ou le Human Microbiome Project).
Tu vois ? Ce n’est pas juste quelques bactéries qui traînent, c’est un véritable écosystème qui fait équipe avec ton corps pour t’aider à vivre ta meilleure vie.
Microbiote ≠ microbe
Il y a encore trop de confusion autour du mot "microbe". On pense directement à maladie, à fièvre, à antibiotiques. Mais tous les microbes ne sont pas pathogènes. Certains sont même nos meilleurs alliés. D’autres sont neutres. Et certains peuvent devenir un peu relous quand l’équilibre est rompu (on en parle juste après 😉).
Petite métaphore : Ton microbiote, c’est un peu comme la population d’une ville. Il y a des citoyens cool, des neutres, et quelques perturbateurs. Tant que la majorité respecte les règles et que la police (ton système immunitaire) fait bien son job, tout roule ! C’est quand les bons citoyens désertent que ça devient le chaos.
Le microbiote intestinal : le boss caché de ton ventre
Si on faisait un sondage pour savoir quels microbiotes les gens connaissent, ce serait sans conteste le microbiote intestinal. Tu sais, celui qui vit dans ton ventre, de l’estomac à l’intestin grêle, en passant par les zones qu’on n’ose même pas nommer à table 😅.
Un colocataire envahissant… mais indispensable
Ton tube digestif abrite environ 100 000 milliards de micro-organismes. Oui oui, tu as bien lu. C’est plus que le nombre de cellules dans ton propre corps. On parle d’un monde intérieur miniature, un vrai holobionte, où chaque microbe a son rôle.
Et la diversité est dingue : il y a plus de 1 000 espèces différentes de bactéries, chacune avec ses propres fonctions.
Incroyable : le microbiote intestinal peut peser jusqu’à 2 kg chez un adulte en bonne santé. C’est autant qu’un foie (aka l’organe le plus lourd du corps humain) !
Une "empreinte" unique, comme une signature
Ton microbiote intestinal, c’est comme une empreinte digitale : personne d’autre sur cette planète n’a exactement le même que toi. Il dépend de plein de facteurs :
- Comment tu es née (voie basse ou césarienne),
- Si tu as été allaitée ou non,
- Ton alimentation (légumes, fibres, aliments fermentés ou plats industriels),
- L’endroit où tu as grandi : des études fascinantes ont démontré que les microbiotes diffèrent énormement en fonction des zones géographiques, en raison notamment du régime de base
- Ton mode de vie (stress, sommeil, activité physique),
- Tes hormones/ phases de vie (grossesse, ménopause, cycle menstruel, .. ),
- Et même les antibiotiques (ex: pilule) que tu as pris dans le passé.
Remarque : C’est pour ça qu’on ne peut pas copier la routine santé d’une copine à l’identique. Son microbiote n’est pas le tien.
Un rôle central dans ton corps
Le microbiote intestinal, c’est un peu le chef d’orchestre de tout ton corps. Il :
- Facilite la digestion et l’absorption des nutriments (protéines, graisses, sucres…),
- Synthétise des vitamines essentielles (comme la B12 ou la K),
- Protège ta barrière intestinale contre les envahisseurs,
- Joue un rôle dans la gestion du poids, de l’appétit et la régulation de la glycémie,
- Et surtout : il communique avec ton cerveau ! (axe intestin-cerveau)
Astuce : Si tu veux chouchouter ton microbiote, pense fibres alimentaires, aliments fermentés (comme la choucroute, le kéfir, le yaourt nature non sucré) et plantes riches en polyphénols.
Et pour ta peau, alors ?
Tu ne le savais peut-être pas, mais un déséquilibre intestinal peut directement se voir sur ton visage. On parle de l’axe intestin-peau : quand ton microbiote intestinal va mal, ta peau peut s’enflammer, produire plus de sébum, ou déclencher de l’acné hormonale.
Exemple : après une période d’antibiotiques ou de stress intense, tu observes une peau terne, des boutons inflammés, un ventre gonflé ? Ton microbiote crie à l’aide.
Dysbiose : quand ton microbiote fait la gueule
Alors là, on entre dans le vif du sujet. La dysbiose, c’est un mot un peu barbare, mais promis, tu vas vite le maîtriser.
C’est quoi, exactement ?
La dysbiose, c’est quand l’équilibre de ton microbiote est rompu. En gros : certaines bonnes bactéries disparaissent, les mauvaises prennent trop de place, et tout ce petit monde devient désorganisé.
C’est un peu comme si tu avais organisé une colocation harmonieuse, et qu’un jour, l’un·e des colocs se met à inviter tous ses potes bruyants. Résultat : disputes, désordre, fatigue… et toi, tu subis 🫠
Les causes les plus fréquentes
Beaucoup de choses peuvent désarçonner ton équilibre microbien :
- Antibiotiques (qui tuent tout, même les gentils),
- Alimentation ultra-transformée (plats tout prêts et sodas),
- Stress chronique (ça dérègle littéralement ton système digestif),
- Carences (notamment en fibres, vitamines B, D...),
- Manque de sommeil ou de mouvement,
- Changements hormonaux (pilule, grossesse, ménopause, SOPK...),
- Exposition à des toxines (alcool, pesticides, pollution...).
Remarque : La dysbiose ne se limite pas à l’intestin ! Tu peux aussi avoir une dysbiose cutanée, vaginale ou même buccale.
Les signaux d’alerte que ton corps t’envoie
Si tu coches plusieurs de ces symptômes, il y a des chances que ton microbiote appelle à l’aide :
- Ballonnements, gaz, digestion lente, diarrhées ou constipation,
- Fatigue inexpliquée,
- Troubles de l’humeur (anxiété, irritabilité, déprime...),
- Acné inflammatoire, peau sensible ou réactive,
- Mycoses à répétition (vaginales, digestives, cutanées...),
- Prise ou perte de poids sans explication logique,
- Baisse de l’immunité (tu tombes malade facilement),
- Crises de SPM plus intenses ou irrégularité du cycle.
A savoir : Prendre soin de son microbiote, c’est aussi prévenir les déséquilibres hormonaux. Tu verras que beaucoup de choses sont liées (cycle, digestion, peau, humeur...).
Rôle central du microbiote dans la santé
On pourrait presque écrire un roman à ce sujet tellement le microbiote est au cœur de notre santé globale. En vrai, il n’y a pas un système du corps qui ne soit influencé, de près ou de loin, par ces microscopiques colocataires. Et ça, les chercheur·euse·s en microbiologie ne cessent de le confirmer à travers des centaines d’études scientifiques, d’articles et de revues systématiques comme celles de Plos One, INRAE ou encore l’Institut Pasteur.
Immunité : ta première ligne de défense
Ton microbiote intestinal joue un rôle crucial dans ton système immunitaire. Il entraîne ton corps à reconnaître les bons et les mauvais microbes. Sans lui, ton corps devient soit trop laxiste (tu chopes tout), soit trop agressif (inflammations, maladies auto-immunes).
Cerveau & émotions : ce que ton ventre chuchote à ta tête
Tu as déjà eu "la boule au ventre" ou le "ventre noué" en période de stress ? Ce n’est pas une image. C’est l’axe intestin-cerveau qui s’active. Le microbiote fabrique des neurotransmetteurs comme la sérotonine (l’hormone du bonheur), ce qui influence :
- Ton humeur,
- Ton anxiété,
- Ton sommeil,
- Ta gestion du stress.
Exemple : un déséquilibre du microbiote peut être associé à des troubles comme la dépression, la fatigue chronique ou même certaines phobies.
Peau, hormones & cycle féminin
Là, c’est notre dada chez Circles ❤️ Le microbiote influence :
- Ta peau (en lien avec l’acné, l’eczéma, la sensibilité cutanée),
- Ton équilibre hormonal (car il dégrade les œstrogènes, donc régule leur niveau),
- Ton cycle menstruel (en impactant les symptômes du SPM ou les douleurs),
- Ta libido (par ricochet sur le stress et les hormones sexuelles).
Bon à savoir : il existe même un sous-groupe du microbiote appelé estrobolome, spécialisé dans la gestion des œstrogènes. S’il est perturbé, boum : règles plus douloureuses, acné hormonale, fatigue...
Poids, métabolisme & maladies chroniques
Selon certaines études (ex : Human Microbiome Project), un microbiote diversifié aide à :
- Stabiliser ton poids,
- Mieux digérer les fibres alimentaires,
- Réduire le risque de diabète, cholestérol, maladies cardio-vasculaires,
- Limiter les inflammations chroniques à l’origine de nombreuses pathologies (MICI, arthrose, endométriose, etc.).
Statistique clé : les femmes atteintes du syndrome de l’intestin irritable (SII) ont souvent une flore intestinale déséquilibrée, avec moins de diversité bactérienne.
Pistes naturelles pour rééquilibrer ton microbiote
Quand ton microbiote part en vrille (dysbiose), pas besoin de paniquer. Il existe des gestes concrets et efficaces pour l’apaiser, le nourrir, et surtout le renforcer sur le long terme. Chez Circles, on parle de solutions douces, ciblées et naturelles, à intégrer progressivement dans ta routine.
1. Les probiotiques : les alliées de ta flore
Les probiotiques sont des bactéries vivantes, bénéfiques, qu’on peut consommer pour renforcer ton microbiote. On les trouve dans certains aliments fermentés ou sous forme de cures.
Exemples d’aliments riches en probiotiques :
- Kéfir (lait ou eau),
- Yaourt nature (non sucré, avec ferments actifs),
- Choucroute crue (pas celle en bocal pasteurisée),
- Kimchi, miso, tempeh.
Astuce : consomme-les en dehors des repas très chauds, sinon la chaleur tue les bonnes bactéries.
Les cures Circles (comme DIGEST) misent justement sur un mélange ciblé de probiotiques + enzymes + plantes pour une digestion plus sereine, un ventre dégonflé et une peau plus calme. A prendre 30 minutes avant les repas midi et soir.
2. Les prébiotiques : la nourriture des bonnes bactéries
Tu vois les bonnes bactéries comme des locataires ? Eh bien, elles ont besoin de nourriture de qualité. C’est là que les prébiotiques entrent en jeu : ce sont des fibres qui nourrissent ta flore.
Top prébiotiques naturels :
Aliments |
Contenu prébiotique |
Poireaux crus |
Inuline |
Topinambours |
Très riche en fibres |
Bananes pas trop mûres |
Fructo-oligosaccharides |
Ail & oignon |
Fibres + antioxydants |
Légumineuses (lentilles, pois chiches...) |
Fermentescibles |
Bon à savoir : Si tu n’as pas l’habitude de manger beaucoup de fibres, vas-y progressivement, pour éviter ballonnements et inconfort. Tu peux tester note MOCHA RITUAL qui t’aidera grâce à des prébiotiques.
3. Les postbiotiques : les stars montantes
Les postbiotiques, ce sont les métabolites produits par les probiotiques (ex : acides gras à chaîne courte). On les trouve encore peu sous forme de compléments, mais certaines plantes, huiles et aliments fermentés peuvent en stimuler la production.
4. La transplantation fécale (oui, ça existe)
Ok, c’est pas très sexy à première vue 🙈 mais c’est une vraie piste médicale étudiée dans les cas graves (ex : infections à Clostridium difficile). Elle consiste à transférer le microbiote intestinal d’un·e donneur·se sain·e vers une personne en dysbiose sévère.
Remarque : Tu n’as pas besoin de tout changer du jour au lendemain. Même ajouter une portion de légumes fermentés par jour ou prendre une cure ciblée peut déjà amorcer de vrais changements.
Focus sur les autres microbiotes
Ton corps est littéralement recouvert et habité par des communautés microbiennes, toutes plus précieuses les unes que les autres. Et chaque microbiote a son propre rôle de garde du corps naturel.
Le microbiote vaginal : ton allié intime
C’est l’un des plus fragiles et précieux, surtout chez les femmes en âge de procréer. Il est dominé par des lactobacilles, des bonnes bactéries qui maintiennent un pH acide et empêchent les infections (mycoses, vaginoses...).
🌸 Quand il est perturbé (stress, règles, antibiotiques, rapports, pilule...), tu peux ressentir :
- Irritations,
- Sécheresse,
- Mauvaises odeurs,
- Perte d'équilibre hormonal.
A savoir : Un microbiote déséquilibré, c’est souvent la dégringolade. Exemple : Lorsque tu prends des antibiotiques, ils ratissent larges et vont détruire toute la flore, les mauvaises bactéries mais aussi les bonnes. C’est pour ça qu’il est fréquent d’avoir des mycoses vaginales suite à un traitement antibiotique.
👉 Chez Circles, on propose des solutions naturelles (comme la cure FLORA) qui soutiennent ton équilibre intime, en agissant de l’intérieur, en douceur. FLORA contient des souches sélectionnées pour leurs bienfaits anti-pathogènes et favorise l’équilibre du microbiote intime.
Le microbiote cutané : ton premier bouclier
Ta peau n’est pas stérile, loin de là. Elle abrite des millions de micro-organismes, qui la protègent des agressions extérieures (UV, pollution, cosmétiques, microbes...).
- Un bon microbiote cutané = peau saine, équilibrée, qui cicatrise vite.
- Un microbiote déséquilibré = acné digestive, eczéma, rosacée, sécheresse.
Remarque : Trop de nettoyage, trop d’actifs agressifs (acides, alcool, rétinol mal dosé), ou une routine inadaptée = microbiote de peau affaibli. On préfère le doux et l’intelligent. Et surtout, on pense à soigner l’intérieur (microbiote intestinal) autant que l’extérieur.
Le microbiote buccal, nasal, ORL...
Eh oui, même ta bouche a son propre écosystème microbien ! Lui aussi aide à digérer, protéger, limiter les caries et l’inflammation.
Et ce n’est pas tout :
- Tes poumons ont aussi un microbiote (encore peu connu),
- Tes yeux, ton oreille interne, ton nez : pareil.
Le microbiote placentaire et du lait maternel
Longtemps, on pensait que l’utérus était stérile. Faux. Des études récentes montrent la présence d’un microbiote placentaire, qui pourrait jouer un rôle dans la santé du bébé à venir. Pareil pour le lait maternel : un vrai "starter pack" bactérien pour les nourrissons 🍼
Pour aller plus loin, écoutez ce podcast de France Culture sur le microbiote